“长三角一体化发展研究中心”是浙江省教育厅于2018年10月认定建设的28个省新型高校智库之一。中心依托嘉兴学院浙江省一流学科应用经济学，整合浙江省全面接轨上海研究中心（2017）、嘉兴公共财政研究中心（2013）和长三角城乡统筹发展研究中心（2011）等科研平台资源组建的相对独立、跨学科、开放性的研究机构。

中心设有长三角科技与产业一体化、长三角生态治理一体化、长三角社会治理一体化、长三角生态绿色一体化发展示范区建设四个研究院，现有兼职研究员40人，其中教授18人、副教授17人，博士26人。近三年，决策咨询类研究成果共获国家级领导批示1件、省部级领导批示7件，市厅级主要领导批示20余件；获省部级奖2项；承担国家社科基金6项，省部级纵向课题40余项，政府委托横向课题近200项，到账科研经费1200余万元；出版专著20余部；发表核心期刊论文120余篇，其中一级期刊论文22篇。

从2019年起，嘉兴学院每年拨付一定的经费用于中心人才引进、课题研究、学术交流、成果推荐等方面的建设工作。未来五年，中心将牢牢把握“服务国家战略、促进浙江发展”宗旨，坚持创新发展重驱动、协同发展重融合、特色发展重优势的原则，致力于建设长三角一体化发展理论研究基地、浙江长三角一体化发展决策咨询基地、复合型智库人才培养基地，力争用3—5年时间，把中心建成省内有地位、全国有影响的高端特色智库